ஈஸ்ட்ரோஜன் மற்றும் புரோஜெஸ்ட்டிரோன் அளவுகளில் ஒவ்வாமை எதிர்வினையாக ஏற்படும் ஹார்மோன் சமநிலையின்மை ஹார்மோன் கோளாறுகள் என அழைக்கப்படுகிறது. எ.கா: அக்ரோமேகலி, அடிசன் நோய், அட்ரீனல் புற்றுநோய், அட்ரீனல் கோளாறுகள், அனாபிளாஸ்டிக் தைராய்டு புற்றுநோய். நீரிழிவு, தைராய்டு நோய், வளர்ச்சிக் கோளாறுகள், பாலியல் செயலிழப்பு மற்றும் பிற ஹார்மோன் தொடர்பான கோளாறுகளில் இது முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது.
ஒரே ஒரு சமநிலையற்ற ஹார்மோன் இருந்தால் கூட, அது எடை அதிகரிப்பு, தூக்கமின்மை, ஃபைப்ரோஸிஸ், மூடுபனி நினைவகம், இரவு வியர்வை, குறைந்த லிபிடோ போன்றவற்றை ஏற்படுத்தும். ஹார்மோன் உடல் மற்றும் உளவியல் பக்க விளைவுகளுக்கு வழிவகுக்கும். ஆண்களிடையே மார்பக வளர்ச்சி, மற்றும் முக முடி வளர்ச்சி, மாதவிடாய் பிரச்சனைகள் மற்றும் பெண்களில் ஆழமான குரல் ஆகியவை அடங்கும். நீண்ட கால சுகாதார விளைவுகள் தீவிரமானதாக இருக்கலாம்: கல்லீரல் கட்டிகள், அசாதாரண கொலஸ்ட்ரால் அளவுகள் மற்றும் இதய நோய், மற்றும் இளம் பருவத்தினரிடையே குன்றிய உயரம்